DNAを試験管内で操作するときに、制限酵素（DNA切断酵素）で処理して小さなフラグメントに分ける作業は重要な実験工程である。自分の持っているDNAにどのような制限酵素サイトがあるかを調べるのに便利なツールが制限酵素サイト検索ソフトである。その一つに New England Biolab 社が提供している NEB Cutterがある。とても便利なサイトである。